紫外線通過減慢水系統(tǒng)中新的菌落生長速度而影響生物膜的生長，但這只對浮游的微生物部分有效，不能消除已經形成的生物膜。單用紫外線并非一種有效的消毒方法，通常需要與常規(guī)的熱水或者化學消毒方式聯(lián)合使用，提高殺菌效果，同時延長消毒的間隔時間。
在185nm的紫外線照射下，水發(fā)生光化學反應而產生羥基自由基，該物質具有很強的氧化性，可氧化水中的部分有機物，從而達到降解TOC的效果；在253.7nm的紫外線作用下，水中臭氧會發(fā)生催化分解作用，最后生成CO2和H2O，從這一作用過程來看，使用紫外線有利于在純化水臭氧消毒后對臭氧進一步降解。
紫外線的殺菌原理和生物體內的核酸相關，核酸主要成分為DNA或RNA。這些物質對紫外線具有吸收作用，并且在紫外線波長為200~300nm時具有殺菌作用。殺菌效果因紫外線波長而異，波長在254~257nm范圍時殺菌效果最佳。通常，純化水系統(tǒng)使用紫外線燈進行殺菌時，輻射光譜能量集中在253.7nm左右。另外，還選用污染少、耐高溫的石英套管，透過率高達90%以上，進一步提升殺菌效果。
紫外線殺菌的缺點在于只能減緩生物繁殖速度而不能瞬間殺滅細菌，并且只能對系統(tǒng)內90%的微生物菌起作用，因此，紫外線殺菌不能取代巴氏消毒等方式來進行周期性消毒或殺菌。
紫外線殺菌器通常安裝在純化水系統(tǒng)中的反滲透裝置和EDI裝置循環(huán)回路，以及純化水儲存與分配管網回路，并與巴氏消毒等消毒方式組合使用，以防止系統(tǒng)中微生物指標的過快增長。
在使用紫外線殺菌器時，應注意及時更換紫外線燈管，通常更換周期為6000-8000個小時。另外，如果純化水系統(tǒng)需進行周期性巴氏消毒時，在系統(tǒng)設計時應選擇耐高溫的紫外線燈。
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